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Los colores
vivos en la fuente prismática son el resultado de bacterias pigmentadas en las
biopelículas que crecen alrededor de los bordes de las aguas ricas en
minerales. La bacteria produce colores que van del verde al rojo, la cantidad
de color en los tapetes microbianos depende de la relación de clorofila a los
carotenoides y de la temperatura del agua que favorezca una bacteria u otra.

El color azul
profundo del agua en el centro de la fuente es resultado del color intrínseco
azul del agua, consecuencia de la absorción selectiva del agua de longitudes de
onda de luz roja visible. Aunque este efecto es responsable de hacer todos los
grandes cuerpos de agua azul, este es particularmente intenso en la Gran Fuente
Prismática debido a la alta pureza y la profundidad del agua en el medio de la
fuente.
Las descargas
de las aguas termales se estima que sean de 560 galones EE.UU. (2.100 L) de 160
°F (70 °C) de agua por minuto.
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